- ראש המכון: פרופ׳ אורי הרשטיין.
- ועדה אקדמית: פרופ׳ מיכל שור-עופרי (יו"ר); פרופ׳ דוד אנוך, פרופ׳ אורי הרשטיין, ד״ר איתי פלדור, ד״ר טל יונתן-זמיר, ד״ר שרון שקרג'י, ד״ר יעל ברדה, פרופ׳ תמר זילבר.
- מנהלת אדמיניסטרטיבית : רויטל בהט (revitalb@savion.huji.ac.il).
ראשי המכון לשעבר:
- ד"ר אורי ידין ז"ל 1959-1969
- פרופ' יצחק זמיר 1969-1971
- פרופ' יצחק אנגלרד 1972-1974
- פרופ' קלוד קליין 1974-1977
- פרופ' יהודה בלום 1977-1978
- פרופ' אהרן יורן ז"ל 1978-1981
- פרופ' גבריאלה שלו 1981-1984
- פרופ' סטיבן גולדשטיין ז"ל 1984-1987
- פרופ' אליהו הרנון 1987-1990
- פרופ' מרדכי ראבילו 1990-1999
- פרופ' סיליה וסרשטיין פסברג 1999-2003
- פרופ' מירי גור-אריה 2003-2004
- פרופ' שמעון שטרית 2004-2008
- פרופ' מיכאיל קרייני 2009-2012
- פרופ' דוד גליקסברג 2013-2016
- פרופ׳ גיא דוידוב 2017-2019